מחלקת התחבורה של מועצה אזורית עמק המעיינות, מונה 12 אוטובוסים. המחלקה עוסקת בהסעת כל ילדי המועצה לבתי הספר האזוריים, במסגרת החינוך הפורמאלי, לרבות הסעות לחינוך לא פורמאלי. המחלקה נעזרת בקבלני משנה להסעות חינוך מיוחד ובנוסף, נותנת שירותי הסעות למחלקות המועצה במסגרת החינוך הבלתי פורמאלי, הסעות עבור מחלקת נוער ועבור המתנ"ס, לפעילות תרבות, ספורט, הסעות לטובת גיל עוז, לסל תרבות ועוד. מחלקת התחבורה, מספקת שירות לכל יישובי המועצה ותושבי המועצה. בנסיעות לאירועים, מופעי תרבות וטיולים בכל רחבי הארץ. הנהגים במחלקה ותיקים, מקצועיים ומיומנים, מסיעים תלמידים לאורך שנים. האוטובוסים נקיים ומתוחזקים היטב, מאובזרים במערכות מדיה מתקדמות. לנהגים מכשירים אלקטרונים, המחוברים למוקד בכל עת הנסיעה.
המועצה האזורית עמק המעיינות, חותרת לשיפור מתמיד ברמת הבטיחות בתחבורה וצי הרכבים שלה מצויד במגוון מערכות בטיחות לרכב. כמו כן, נהגי החברה עוברים מדי שנה השתלמות והדרכות בנהיגה בטוחה על ידי חברות הדרכה המוכרות ומאושרות על ידי הרשות הלאומית לבטיחות בדרכים. כל הנהגים עוברים אחת לשנתיים בדיקה רפואית מקפת וצי הרכבים של המועצה נתון לבדיקה ומעקב קבוע של קציני הבטיחות בחברה.
